МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧНА ХАРАКТЕРИСТИКА ІЗОЛЯТІВ ВІРУСУ ЕНЗООТИЧНОГО ЕНЦЕФАЛОМІЄЛІТУ СВИНЕЙ ВИДІЛЕНИХ ВІД ДИКОГО КАБАНА І ДОМАШНЬОГО ПІДСВИНКА НА ТЕРИТОРІЇ УКРАЇНИ
М.П.Ситюк1, В.Г.Спірідонов2, В. O.Постоєнко1, С.Д.Мельничук2, В. В. Недосєков2
1Інститут ветеринарної медицини Національної академії аграрних наук, вул. Донецька, 30, м. Київ, 03151, Україна
2Національний університет біоресурсів і природокористування, вул. Героїв Оборони, 15, м. Київ, 03041, Україна
У статті приведені результати виявлення двох ізолятів вірусу ензоотичного енцефаломієліту свиней з території України: від домашнього підсвинка і дикого кабана. Ізолят вірусу ензоотичного енцефаломієліту свиней «Шевченково-2005» був виділений від хворого підсвинка у 2005 році у приватному секторі на території Київської області. Ізолят вірусу ензоотичного енцефаломієліту свиней «Новоазовський-2013» був виділений від відстріляного дикого кабана з території Луганської області. Спершу було проведено індикацію ізолятів вірусу у культурі клітин СНЕВ з їх подальшою ідентифікацією за чутливості до хлороформу. Для виявлення РНК вірусу ензоотичного енцефаломієліту свиней було використано полімеразну ланцюгову реакцію з наступним секвенуванням VP1 кДНК. Результати дослідження показали, що згадані вище ізоляти відносяться — до першої групи Teschovirus — PTV 1. Розробленими нами праймерами, які були б специфічні для майже всіх серотипів Teschoviruses, проаналізовані нуклеотидні послідовності, що кодують VP 1 із 11 доступних серотипів. Це дозволило виявити консервативний регіон за допомогою дизайну олігонуклеотидных праймерів (PTV-F, PTV-R). Філогенетичний аналіз амінокислотних послідовностей капсидного білка VP 1 Teschoviruses українських ізолятів і різних серотипів показали, що віруси України відносяться до перщої Teschovirus групи (PTV 1). Виявлені деякі точкові мутації ізолятів можуть бути пов’язані з їх рекомбинацією, що властиво для всіх членів родини Picornaviridae. Виявлені послідовності українських ізолятів були занесені в GenBank (KJ081865, KJ081866 та KJ081867).
Ключові слова: ВІРУС ХВОРОБИ ТЕШЕНА, ДОМАШНІЙ ПІДСВИНОК, ДИКИЙ КАБАН, ІДЕНТИФІКАЦІЯ, ПОЛІМЕРАЗНА ЛАНЦЮГОВА РЕКЦІЯ, СЕКВЕНУВАННЯ, ФІЛОГЕНЕТИЧНИЙ АНАЛІЗ
